Valmistajan on otettava huomioon kustannukset ennen vedenkäsittelylaitteiden ostamisen aloittamista. EDI ultra: n alkuperäiset ostokustannukset-puhtaan veden kone on suhteellisen korkea. Tiukkojen teknisten standardiensa vuoksi koneen hinta ei ole alhainen. Tavallisiin ioninvaihtolaitteisiin verrattuna sen kustannustehokkuus on kuitenkin edelleen erittäin korkea. Yleinen ioni esim-vaihtajia ei voida tuottaa jatkuvasti, ja uusiutumiseen tarvitaan paljon happoa, emästä, työvoimaa ja aikaa. Tätä ei voida verrata EDI-koneisiin, joissa on korkeampi automaatioaste. Jos ioninvaihtopylvään manuaalinen regenerointikone vaihdetaan täysin automaattiseksi regenerointikoneeksi EDI-koneen automaatiotason saavuttamiseksi, lisäksi jatkuvan tuotannon varmistamiseksi kaksi sarjaa-vaihtajia on käytettävä. Yksi onkäynnissäja toinen on valmis. Investointi on melkein sama kuin ED-koneen, kun taas ionin käyttökustannukset ovat ex-vaihtaja on paljon korkeampi.
EDI-puhdasta vettä sisältävillä laitteilla on etuja, joita perinteisellä tekniikalla ei ole. Kun valmistajat käyttävät erittäin puhdasta vesilaitetta, he ottavat yleensä huomioon koneen taloudellisuuden. Teollisuudessa käytetty puhdas vesi aloittaa tuotannon erittäin puhdasta vettä sisältävillä EDI-laitteilla.